Minimales Genom

Bioinformatics Dr Doping erzählt über die Gene des gemeinsamen Ahnen, die Gene von Bakterien von Escherichia coli und Konkurrenz abdrehend.

Was sind die verschiedenen Annäherungen zum Definieren des minimalen Genoms? Als durchgeführte experimentelle Genforschungsmethoden die sind erforderlich?

Es gibt mehrere Annäherungen an die Definition dessen, was das minimale Genom ist. Zuerst - ist es evolutionär. Es basiert auf der natürlichen Philosophie, dass, wenn ein bestimmtes Gen in allen Organismen da ist, Sie wahrscheinlich ohne dieses Gen nicht auskommen können. Hier gibt es wirklich eine Täuschung. Weil, wenn ich sage, dass dasselbe Gen in verschiedenen Organismen da ist, die Frage entsteht, und wie tun, weiß ich, dass das ein und dasselbe Gen ist und das alles ein und dasselbe Gen ist, wenn es in drei verschiedenen Genomen ist. Die Entwicklungsdefinition ist: Wir glauben, dass das ein und dasselbe Gen ist, wenn sie einen gemeinsamen Ahnen hatten und die Geschichte dieses Gens genau dieselbe Art der Geschichte ist, d. h. gab es keine Verdoppelungen, und die Gene haben sich nur infolge der Artbildung unterschieden.

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Wenn Sie Bakterien auf einem Medium, der einzigen Quelle von Kohlenstoff wachsen, der, zum Beispiel, fructose ist, und Sie haben Beförderer fructose getötet oder Enzym getötet, das die erste Reaktion der fructose Nahrung, alles in Ihrer Umgebung katalysiert, außer fructose, nichts und der Möglichkeit, haben Sie es gebrochen. Und wenn Sie in demselben Umgebungsströmentraubenzucker sind, wird es wunderbar sein, zu leben und zu gedeihen. Also hier müssen wir sagen, dass wir sie eine reiche Umgebung werden anbauen lassen, in der es alles gibt, was sie brauchen, und minimales Genom solch eine Umgebung betrachten könnte. So tun Leute, und es auch angemessene Definition ist. Es ist weicher als evolutionär. D. h. die Gene, die absolut universal sind, sinken evolutionär als Gene, die für solch eine Person erforderlich sind, wird abgedreht.

Experimente sind jetzt minimale Genome von den meisten Läufen durch Craig Venter, der am menschlichen Erbgut beteiligt wurde, und dann auf die Genome von Bakterien umgeschaltet hat. Angewandt die Idee, dass dabei er versucht, ich offen gesagt nicht sehr viel zu verkaufen. Weil er diese Idee hat, dass wir hier sind, um ein minimales Genom zu machen, und dann wir dazu einige Stücke fakultativ hinzufügen und beauftragt von den Bakterien, "dem Design" tun werden, das wir brauchen. Ich verstehe nicht wirklich, warum es technologisch gerechtfertigt wird, weil wir es wirklich jetzt tun können. Wir können den E. coli nehmen - wir haben eine Reihe technologischer Beanspruchungen - und sie können dasselbe machen. Aber Venter sagt, dass es nichts Zusätzliches geben wird. Andererseits wird es sicher nichts Zusätzliches sein, aber wird zur gleichen Zeit ganz Toter sein.