FAQ: Metagenome

7 Tatsachen über die Studie des Gesamtgenoms von Bakterien

Das Gesamtgenom einer Gemeinschaft von Organismen hat metagenome genannt. Zum Beispiel, dort metagenom Bakterien, die im menschlichen Mund leben. Tatsächlich ist es nicht sehr genau, weil in den Zahnflecken eine Gemeinschaft, die Sprache oben auf den anderen Leben, vom Boden - das dritte und so weiter leben. Es wurde vermutet, dass die Bakteriengemeinschaften sehr verschieden sind, aber es gab keine gute Weise, diese Ungleichheit zu beschreiben.

1. Eine der Hauptüberraschungen, wenn die Methoden der Analyse, indem es die genetische Folge identifiziert worden ist, war es gerade wie große Vielfalt. Es sind Hunderte von Genomen, über dessen Mehrheit vorher nichts gewusst hat. Sie werden nicht kultiviert, d. h. wir können sie durch klassische mikrobiologische Agenten nicht studieren, und die einzige Sache, die wir mit ihnen machen können - soll studieren und ihre genomic Folgen vergleichen.

2. Im Mann sind die Bakterienzellen mindestens 10mal größer als seine eigene Zelle. Von der Perspektive der Bakterien wir das einfach große Wandern nach Hause. Klar ist die Bakterienzelle wesentlich kleiner als menschliche Zellen, aber, dennoch, 1-2 Kilo von Bakterien tragen wir.

3. Mann - dieser symbiotische Organismus, weil wir von Bakterien sind, die in uns leben, ist sehr abhängig. Zum Beispiel wirken sie mit unserem Immunsystem aufeinander. Viele autogeschützte Krankheiten, besonders autogeschützte Darmkrankheit, sind eine Folge der Armut Bakterienflora: Das Immunsystem beginnt, trocken zu laufen. Einigermaßen, unsere Bakterien schützt gegen Pathogene: Wenn Sie eine gesunde Bakteriengemeinschaft haben, und Sie in die inneren pathogenen Bakterien haben, werden sie nicht im Stande sein, in diese Gemeinschaft einzudringen. Außerdem kommen wir Metabolismus mit diesen Bakterien vor. Vitamine erzeugen Darmflora für uns: Wir bekommen etwas von ihrem Essen und machen einen bedeutenden Bruchteil unserer Darmbakterien. Einspritzung von Cyanocobalamin - ist für die DNA-Synthese notwendig.

Es gibt mehrere internationale Projekte für die Studie und den Vergleich von Teilen des menschlichen microbiome verschiedenen. Sie können ihre Ungleichheit beschreiben, und wir können versuchen, die funktionellen Eigenschaften des microbiome im Allgemeinen zu beschreiben. Verschiedene Leute haben individuellen microbiome. Es ist bekannt, dass fettleibige Leute und magere Struktur von verschiedenen Typen von Bakterien, die im Eingeweide leben. Das kann experimentell untersucht werden: Sie nehmen mehrere sterile junge Hunde, einige Bakterien stecken ein anderen - der andere an, und selbst wenn die jungen Hunde von derselben Sänfte, einige auf den Zehnen des Prozents mehr wiegen werden als andere für dieselbe Fütterung.

4. Aus einem medizinischen Gesichtspunkt, einem sehr bedeutenden Einfluss von Antibiotika, weil Antibiotika - sind, was Bakterien tötet. Töten Sie Sie wollen Pathogen, aber Sie Grass und seine eigene Bakterienflora. Dort sind nicht sehr appetitlich, aber ein angemessenes Verfahren, wenn eine Person vor dem Geben von ihm große Dosen von Antibiotika, sammelt Stuhlproben und dann die Darmmikroflora wieder herzustellen, diese Proben werden zurück seine Eingeweide eingeimpft.

Es gibt ganz eine große Gruppe von Bakterien, den so genannten opportunistischen, die immer und normalerweise da sind, keine Wirkung auf eine Person, hat und die Schwächung des Körpers mit hohen Dosen von Antibiotika nicht, wenn sie die Mikroflora ändert, oder hat Probleme mit der Immunität, sie beginnen, Krankheit zu verursachen.

Ein typisches Beispiel - ist Staphylokokkus aureus, es ist auf der Haut der Hälfte der Leute da, und die Wundrose darin geschieht noch überhaupt nicht. Die meisten dieser Bakterien werden nicht kultiviert.

5. Es gibt schöne Arbeiten metagenomic Analyse der Ozeane in der Welt. Craig Venter - einer der Autoren der ersten Artikel über das menschliche Erbgut und seines folgenden großen Projektes war gerade eine metagenomic Analyse des Ozeans. Er hat ein Boot gekauft und ist vom Neufundland durch die Landenge Panamas im Pazifik gesegelt, und hat unterwegs Wasserprobe geschöpft und bestimmt dann die Folge die Genome von Bakterien, die in diesen Proben leben. Der Bakterien, die die Ozeane in der Welt bewohnen, wissen wir ganz wenig, und das ist ein großer Anteil in der Produktion von Sauerstoff im Vergleich zu Wäldern, die wir sind, so aktiv verteidigen. Der Hauptteil von Sauerstoff macht einzelligen cyanobacteria im Ozean.

6. Es gibt exotische und sehr schöne Beispiele der schlechten Studienarten microbiome vereinigt mit ungewöhnlichen Bedingungen. Zum Beispiel gibt es eine ehemalige Eisenmine mit acidic Wasser, tatsächlich ist es verdünnte Schwefelsäure. Es gibt mehrere Typen von lebenden Bakterien. Gewöhnlich, wenn Sie metagenomics tun, dann ganze Genome wieder aufbauen, kann nicht: Sie haben Stücke erhalten. Und wenn wenige Arten, und mit vielen Stücken lesen, dann beginnen sie, in ganzen Genomen zusammenzukleben. Dort ist bereits eine Hybride von klassischen mikrobiologisch und Metagenomic-Annäherungen verfügbar.

7. Es gab auch eine wunderbare Geschichte über einen Seewurm Olavius algarvensis, der keinen Magen hat. Statt dessen hat es einige in Symbiosebakterien lebende Haut. Wieder haben wir sequenced plötzlich und die metabolische Beziehung zwischen diesen Arten beschrieben: Ein Aminosäurenwurm tut jemand hilft ihm, Substrate für die Atmung liefernd. Vom Wurm brauchen auch Bakterien, um es zu kriechen, da sie selbst über lange Entfernungen nicht reisen können. Es erweist sich eine Straßenbahn, die sich zu wo die gewünschte Konzentration des Schwefels, Eisens und Kohlendioxyds bewegt. Individuell, alle diese Wesen, um unmöglich zu wachsen: Sie können nur als eine einzelne Person bestehen. Das ist solch eine wunderbare metagenomic Geschichte.